Arduino.ru

А зачем ардуине два питания? Не надо так соединять. Выбросьте красный провод. Чёрный оставьте.

Как то слишком заморочено

на арду  свои 12 в , все можно от арды запитать ее 5в

у блока реле есть оптронная развязка, на него отдельные 12в, хотя и от ардуинских ничего страшного не будет, у мну работает без вопросов

А сколько Ампер может пропускать вывод напряжения 5v?

смею утверждать, что те миллиамперы, которые потребляет Ваша периферия, ардуинский стабилизатор потянет.