Любую мощную нагрузку подключайте через реле или транзистор.

Электромагнит это сильноточная индуктивная нагрузка. Питать электромагнит следует от отдельного источника, а коммутировать, как правильно пишет Jeka_M, через реле или транзистор. При этом параллельно катушке электромагнита обязательно нужно ставить диод в обратном включении. Вариантов конкретных схем может быть весьма много. pahuchiy, электромагнит больше всего похож на мощное электромагнитное реле, поэтому поищите на форумы темы по подключению реле к Ардуино. Если какая-либо схема понравится больше остальных, её можно будет обсудить предметно.